忽然，六祖惠能觉得心血如浪翻卷，即双手合十：“我再送一首偈给你们。”
法海禅师：“师父请讲。”
六祖惠能：“兀兀不修善，
腾腾不造恶。
寂寂断见闻，
荡荡心无著。”
言毕，六祖惠能右手朝上一抬，向弟子们高叫一声：“我去也!”随之一道白虹冲天而起，耀人眼目，直抵穹苍，向国恩寺南边方向而去。
炫目的白光过后，众僧觉得地显奇珍，天呈异瑞。
一时间，狂风折树，暴雨滂沱。
弟子们大吃一惊，六祖惠能原来坐着的禅台之上，已是空无一物。
“师父哪里去了?”众门徒议论纷纷，慌忙走出国恩寺，冒着倾盆大雨，分头到四周去寻找。
四野茫茫，雷电交加，偶尔的闪电划空，将大地照得一片惨白，却见不到六祖惠能的尸体。
神会指着那边：“那边有异样的白色虹光冲天，我们不妨到那里去寻找一下。”
“好。”一些门徒沿着白光冲去的方向寻觅过去，走了约莫五里，见一处山坑内有白光熠熠，他们急忙上前，见白光起处，六祖惠能坐在一块巨石上，身相端庄，脸色安详、眼睛微闭，双手合十，好像在生的模样。
神会带着师兄弟们连忙奔了过去，大声地叫唤：“师父，师父!”
六祖惠能却没有作声应答。
徒弟们用手去推他，叫唤：“师父醒醒!师父醒醒!”
六祖惠能仍是闭着眼睛不醒。
徒弟们用手放到六祖惠能的鼻孔下，试试鼻息，此时，他的鼻孔已无一丝气息。
神会用耳紧贴到六祖的胸脯上，屏神谛息，细听胸音，里面静悄悄的，连极其轻微的声音也没有了，道：“啊，师父已经圆寂了。”
六祖惠能的徒弟们放声大哭。
有的哭喊呼号，
有的捶胸顿足，
龙山附近，百鸟哀鸣，猿猴痛叫，声震山谷。
正是：“鸟连韵以哀啼，猿断肠而叫咽。”
佛教禅宗的第六代祖师就这样在他出生的故乡，与世告别了。
六祖惠能的世寿为七十六岁。
徒弟们将六祖惠能的肉身移奉于寺田村后山的石岩内(后更名为藏佛坑)。
六祖惠能圆寂的消息传出，佛门弟子与平民布衣无不潸然泪下。